OBJ格式的模型导入Microstation，模型是一个整体，不能单独选中某一个构件，请问有解决方案吗？

我看您是通过参考（Reference）将OBJ引入的，整个参考都会作为一个整体。你可以考虑选菜单File > Import > 3D Modeling File Types > OBJ将OBJ文件导入到当前DGN中试一下。

还是一样

那可能就要从原始的OBJ入手了。需要将每个对象导出成一个OBJ文件。

这恐怕行不通，成千上万个构件

有用户是通过编程实现的批处理导出。手工一个个处理确实不太现实。