Existe una opción que nos permite recortar elementos con un acercado de varios modos dependiendo de cómo queramos que el recorte funcione, este puede automáticamente cerrar formas, superficies y sólidos o recortar elementos.
1- Vamos a ir a Espacios de trabajo > Preferencias > Operación (en el menú de la izquierda) y marcaremos la casilla de recorte optimizado de cercado.
2- En la siguiente imagen se ve el cercado que hemos colocado que abarca dos elementos:
3- Con el recorte optimizado activado.
4- Con el recorte optimizado desactivado.
http://communities.bentley.com/products/microstation/w/microstation__wiki/17154.optimized-fence-clipping